Sebanyak 16 tim berhasil melaju ke babak selanjutnya yaitu babak closed qualifier (kualifikasi tertutup) setelah berhasil melewati babak kualifikasi terbuka.
16 tim ini kemudian dibagikan kedalam dua grup. Aerowolf, Flash Wolves, SFI, dan Onic yang merupakan tim dari kualifikasi terbuka dan sekarang bergabung kedalam 12 tim yang mendapat direct invite untuk bertanding di closed qualifier atau kualifikasi tertutup.
Berikut pembagian grup dibabak kualifikasi tertutup Piala Presiden Esports 2019.
GRUP A
RRQ
Bigetron Esports
Alter Ego
NXL
XcN
ONIC
BOOM ID
Aerowolf
GRUP B
EVOS Esports
PG Barracx
Louvre
Recca Esports
Capcorn
Flash Wolves ID
The Prime
SFI Critical
